Az eredeti malom 1920-ban volt felépítve, a tulajdonosa Szivanyó Béla volt. 1945-ig működött, amikor is rejtelmes körülmények között leégett. Ezzel megsemmisült az utolsó vízimalom a nagy Dunán. A vízimalom másolatának elkészítésére a hetvenes évek végén és a nyolcvanas évek elején került sor. A malom 1982-re lett készen.
A technikai tökéletességnek az árnyoldala – a malmot nem sikerült használhatóvá tenni. Azok a kezdeményezések, melyekkel a malomból éttermet szerettek volna kialakítani, sikertelenek voltak. Így a vízimalom a komáromi hajógyár kikötőjében lassanként az enyészetnek indult.
1990 szeptemberében került a vízimalom a mostani helyére, Gútára, a Kis-Duna folyó torkolata közelébe. 1995. május 25.-én a Természetvédő egyesület tulajdona lett, jelenleg pedig országunk Nemzeti kulturális emléke, mely a nyilvánosság által megtekinthető. Része lett annak a festői szépségű tájnak, amely a Kis-Duna és a Vág folyók összefolyásánál gyönyörködteti a természetkedvelő ember

A múzeum nyitvatartási ideje:
• nyári turista szezonban (május l.-től – október 15.-ig): 9.oo – 22.oo óráig
• téli szezonban (október 16.-tól - április 30.-ig): 12,oo – 22,oo óráig

Az előre bejelentett látogatók a fenti nyitvatartási időn kívül is megtekinthetik a múzeumot.
A múzeum megtekintésének díja:
20,- Sk felnőtt személyek részére
10,- Sk 15 éven aluli gyermekek részére
Forrás: vodnymlyn.sk